fix,
1. выделяешь (подсвечиваешь) нужные объекты:
- зажать Shift + клик (мышкой все объекты)
- зажать Ctrl + клик (каждый в отдельности)
2. Заходишь во вкладку Create из нисподающего списка выбираешь New Group.

3. В открывшемся окне вводишь название группы.

Подскажите пожалуйста можно ли переименовывать имена объектов во вкладке Scene?

Можно, а иногда, когда в сцене несколько генезисов, то и нужно:
Как делается:
Вариант 1. Можно дважды кликнуть по названию модели (не всегда срабатывает)
Вариант 2.
- Выбираем модель во вкладке Scene
- Заходим в Edit->Figure->Scene Identification

- В появившемся окне в поле Node Label вписываем желаемое имя модели.
Результат на скрине. При сохранении сцены, сохраняется и новое название модели.